药物设计学-第3版

**章 药物设计的生命科学基础 **节 药物作用的生物靶点 一、生物靶点的分类 二、生物大分子的结构与功能 第二节 药物与生物大分子靶点的相互作用 一、药物与生物大分子靶点相互作用的化学本质 二、药物与生物靶点相互作用的适配关系 三、药物与靶点相互作用的基本理论 第三节 生物膜与药物的跨膜转运 一、生物膜的基本结构与功能 二、生物膜的物质转运机制与调节 三、影响膜转运的分子药理学第二章 基于细胞信号转导途径的药物设计 **节 细胞的信号转导 一、信号与信号转导的物质基础 二、化学信号分子 三、细胞的信号接收系统 四、细胞内信号转导系统 五、第三信使 六、对信号转导系统的药物干预 第二节 基于调节 第二信使的药物设计 一、调节 camp和cgmp信号通路的药物设计 二、调节 钙的药物设计 三、调节 激酶系统的药物设计 第三节 基于调节 第三信使的药物设计 一、维甲酸受体和类维甲酸受体配基的药物设计 二、过氧化物酶体增殖因子激活受体配体的药物设计 三、维生素d受体配体的药物设计第三章 基于生物活性肽的药物设计 **节 肽类化合物的结构与功能 一、肽类化合物的结构特征 二、机体中某些重要的内源性生物活性肽0 第二节 类肽的设计原理与方法 一、构型限制性氨基酸的设计 二、肽链骨架的修饰 三、二肽片段拟似物 四、整体分子构象的限定 五、肽二级结构的分子模拟 六、基于内源性活性肽与靶点结合后的拓扑结构分子设计 第三节 类肽在药物设计中的案例分析 一、苯并二氮革二酮类hdm2-p53抑制剂 二、β-分泌酶抑制剂 三、环肽类组蛋白去乙酰化酶抑制剂第四章 基于酶促原理的药物设计 **节 酶促反应的基础知识 一、酶促反应理论 二、酶的激活与抑制 第二节 酶抑制剂的设计原理 一、酶抑制剂的发展与分类 二、酶抑制剂的合理设计 第三节 酶抑制剂类药物 一、hiv逆转录酶抑制剂 二、酪氨酸激酶抑制剂 第四节 案例分析：波西匹韦的发现 一、研究背景 二、苗头化合物的发现 三、先导化合物的确定及优化 四、上市药物波西匹韦的确定第五章 基于核酸原理的药物设计 **节 核酸的生物合成 一、嘌呤核苷酸的合成 二、嘧啶核苷酸的合成 三、核苷二磷酸、核苷三磷酸及脱氧核糖核苷酸 第二节 代谢拮抗类抗肿瘤、抗病毒药物的设计 一、叶酸类抗代谢物 二、嘌呤类抗代谢物 三、嘧啶类抗代谢物 第三节 核苷类抗病毒药物的设计 一、基于核苷糖环修饰的药物 二、基于核苷碱基修饰的药物 三、无环核苷 第四节 反义核酸与小干扰rna药物的设计 一、反义核酸药物 二、小干扰rna药物 第五节 表观遗传与药物设计 一、dna甲基化及其机制 二、dna甲基转移酶抑制剂的设计第六章 基于代谢原理的药物设计 **节 药物代谢与新药设计 一、发现先导化合物 二、优化先导化合物 三、指导设计合适的剂型 第二节 前药设计的基本原理 一、前药的基本概念 二、前药设计的目的与方法 三、前药设计原理的应用 四、生物前体药物 第三节 软药 一、软药的基本概念 二、软药的设计原理及其应用 第四节 靶向前药 一、主动靶向前药设计及其应用 二、被动靶向前药设计及其应用第七章 基于生物电子等排原理的药物设计 **节 生物电子等排体的一般概念 一、生物电子等排体的提出与发展 二、生物电子等排体的分类 第二节 生物电子等排原理在药物设计中的应用 一、经典的生物电子等排体的应用 二、非经典的生物电子等排体的应用 第三节 me too药物的开发 一、me too药物的基本概念 二、me too药物的设计策略 三、me too药物的成功案例第八章 基于分子杂合原理的药物设计 **节 分子杂合原理与孪药 一、分子杂合原理的概念 二、孪药的分类 三、孪药原理的应用 第二节 多靶点药物 一、多靶点药物概述 二、多靶点药物的设计策略 三、案例分析：培美曲塞的研发历程 四、多靶点药物在各类疾病中的应用第九章 基于组合化学技术的药物设计 **节 组合化学的基本原理 一、组合化学的概念 二、组合化学的原理 第二节 组合化学库的构建 一、组合库的设计 二、组合库的构建方法 三、组合库合成技术 四、化合物库生物活性成分结构识别 五、组合库发展趋势 第三节 高通量筛选技术r 一、高通量筛选技术的组成 二、计算机虚拟筛选 三、高通量筛选发现药物的基本过程 第四节 案例分析——抗疟药物靶点plasmepsin ⅱ抑制剂的筛选第十章 基于化学基因组学原理的药物设计 **节 化学信息学 一、化学信息学的概念 二、化学信息学的分子模型化技术 三、化学数据的分析和化学数据库的创建 四、化学信息学与新药开发 第二节 生物信息学 一、生物信息学的概念 二、生物信息学的研究目标和任务 第三节 化学基因组学与药物设计 一、化学基因组学发现和确证药物及其靶标 二、化学基因组学的关键技术第十一章 基于靶点结构的药物分子设计 **节 靶蛋白结构的预测 一、蛋白质三维结构预测 二、活性位点的分析方法 第二节 分子对接与虚拟筛选 一、分子对接 二、计算机虚拟筛选技术 三、反向分子对接 第三节 全新药物设计 一、全新药物设计基本概念 二、全新药物设计的分类 第四节 基于片段的药物分子设计 一、基于片段的分子设计原理与方法 二、活性片段的检测技术 三、从活性片段到先导化合物的研究方法 第五节 案例分析：基于靶点结构的药物设计在hiv蛋白酶先导化合物发现的应用 一、研发背景 二、先导化合物的发现第十二章 基于配体结构的药物设计 **节 定量构效关系 一、二维定量构效关系 二、三维定量构效关系 三、qsar案例分析 第二节 药效团模型及其应用 一、药效团元素的概念 二、三维药效团的构建方法 三、基于药效团的三维数据库搜索 四、骨架跃迁技术的概念与应用 五、案例分析第十三章 类药性及其在药物设计中的应用 **节 基本概念 一、药物在体内的过程 二、药代动力学及其参数 三、药物毒性 第二节 类药性及其评价方法和应用 一、基于经验判断的类药性评价 二、基于理化性质的类药性评价 三、基于admet性质的类药性优化 第三节 基于类药性的药物设计策略 一、早期类药性评价 二、快速、并行的成药性优化 三、应用案例——索非布韦的发现第十四章 新药开发的基本途径与方法 **节 药物作用靶点的发现 一、人类功能基因组学的研究 二、与重大疾病相关基因的发现与表达 第二节 先导化合物的发掘与结构优化 一、先导化合物的发现 二、先导化合物的结构优化 第三节 临床候选药物的研究与开发 一、临床前体内外药效学评价 二、临床前安全性评价 三、临床前药学研究 四、药物临床研究 第四节 创新药物研发实例：托法替尼的发现 一、研发背景 二、苗头化合物的发现 三、先导化合物的确定与优化 四、候选药物的确定 五、托法替尼的临床研究参考文献中文索引英文索引