十六元大环内酯查尔霉素和阿德加霉素的生物合成机制研究

1 绪论 001
1.1十六元大环内酯类抗生素的生物合成研究现状 002
1.2糖的生物合成及在天然产物改造中的应用研究现状 015

2 Streptomyces sp.HK-2006-1主要代谢产物分离鉴定及遗传转移系统的建立 034
2.1Streptomyces sp.HK-2006-1主要代谢产物分离鉴定 035
2.2Streptomyces sp.HK-2006-1遗传转移系统的建立 043
2.3小结 046

3 阿德加霉素和查尔霉素生物合成基因簇的鉴定及边界的确定 048
3.1阿德加霉素类化合物和查尔霉素类化合物由同一基因簇合成 049
3.2全基因组测序 051
3.3基因簇边界的确定 055
3.4小结 059

4 阿德加霉素和查尔霉素生物合成基因簇基因功能分析及生物合成途径推测 060
4.1阿德加霉素类化合物和查尔霉素类化合物聚酮母核生物合成途径推测 061
4.2内酯环骨架后修饰推测 063
4.3脱氧糖生物合成途径推测 064
4.4脱氧糖与大环内酯母核组装 067
4.5阿德加霉素和查尔霉素合成相关调节基因和抗性基因 068
4.6小结 069

5 阿德加霉素和查尔霉素生物合成基因簇中关键基因的功能研究 070
5.1阿德加霉素和查尔霉素生物合成分支基因的确定 071
5.2查尔糖3-酮基还原基因的确定 076
5.3糖基转移酶基因almTⅠ的敲除验证 078
5.4小结 080

6 查尔糖3位甲基化酶的鉴定与功能研究 082
6.1查尔糖3位甲基化基因的确定 083
6.2查尔糖3位甲基化酶基因almCⅡ功能的体外研究 091
6.3新产化合物7和8的抗菌活性检测 097
6.4小结 098

7 阿德加糖碳酸酯生物合成机制研究 102
7.1阿德加糖五元碳酸酯环的形成是一种后修饰作用 103
7.2喂养实验锁定与阿德加糖五元碳酸酯环形成相关的基因范围 104
7.3与五元碳酸酯环形成相关的基因的敲除验证 106
7.4阿德加糖五元碳酸酯环生物合成相关基因底物喂养实验 112
7.5S.coelicolor系统：免疫共沉淀验证蛋白复合体 114
7.6pTNT/S.lividans——蛋白质高表达系统 116
7.7化合物9的分离及结构鉴定 129
7.8小结 132

附录 135

参考文献 148