常用生物数据分析软件-(含光盘)

序前言第1章 Unix/Linux操作系统介绍 1.1 远程登录 1.2 文件的复制、删除和移动命令 1.3 目录的创建、删除及更改目录命令 1.4 文本查看命令 1.5 文本处理命令 1.6 改变文件或目录的权限命令 1.7 备份与压缩命令 1.8 磁盘及系统管理 1.9 软件安装简介 1.10 其他第2章 数据的基本处理 2.1 数据常用格式介绍 2.2 测序原理介绍 2.3 華图转化(Phred) 2.4 文件转换(phd2fasta) 2.5 载体屏蔽(cross_match) 2.6 序列聚类拼接 2.7 Consed 2.8 引物设计(Primer3) 主要参考文献第3章 序列的比对 3.1 全局比对 3.2 局部比对 主要参考文献第4章 基因组/基因的注释 4.1 重复序列分析 4.2 RNA分析 4.3 基因预测 4.4 基因功能注释 主要参考文献第5章 SNP分析 5.1 Polyphred 5.2 SNPdetector 5.3 cross_match 主要参考文献第6章 进化分析专题 6.1 Phylip 6.2 Paml 6.3 KaKs_Calculator 6.4 FGF 6.5 MEGA 主要参考文献第7章 基因表达分析专题 7.1 EST表达序列标签分析 7.2 生物芯片分析 7.3 Motif预测 主要参考文献第8章 蛋白质结构预测 8.1 蛋白质结构知识介绍 8.2 蛋白质结构预测方法 8.3 蛋白质结构预测的Threading方法 8.4 蛋白质三维结构预测流程介绍 主要参考文献