植物代谢组学——方法与应用(第二版)

第1章　概述 001
1.1　代谢物分析技术的发展趋势 003
1.2　代谢组学数据分析现状及其面临的挑战 008
1.3　植物代谢组学的应用 013
参考文献 019

第2章　代谢组学分析技术：气相色谱-质谱联用技术 026
2.1　GC-MS联用的原理和关键技术 027
2.2　样品制备和分析技术 035
2.3　新技术、发展趋势 039
2.4　常见问题，注意事项 041
2.5　展望 044
参考文献 045

第3章　代谢组学分析技术：液相色谱-质谱联用技术 047
3.1　LC-MS基本原理 048
3.2　数据解读 052
3.3　新技术与发展趋势 053
3.4　常见问题和注意事项 057
3.5　展望 061
参考文献 061

第4章　代谢组学分析技术：核磁共振技术 064
4.1　核磁共振发展概况 065
4.2　核磁共振基本原理 065
4.3　核磁共振波谱仪 067
4.4　化学位移 068
4.5　自旋耦合 075
4.6　常见基团的化学位移范围 076
4.7　代谢组学研究中常用的二维谱 082
4.8　核磁共振谱图解析 084
4.9　常见问题及解决方案 095
4.10　植物代谢组学研究中样品的提取方法 097
4.11　新技术及发展趋势 098
参考文献 100

第5章　代谢组学数据预处理分析方法 102
5.1　NMR数据集的预处理 103
5.2　MS数据预处理 106
参考文献 113

第6章　基于代谢组学数据的多变量分析 115
6.1　引言 116
6.2　基于单维统计模式识别 116
6.3　多维统计模式识别 118
6.4　数据模型的识别和验证 129
6.5　模式识别的软件工具 130
6.6　代谢组和其他组学数据的联合分析 132
6.7　小结 140
参考文献 140

第7章　基于色谱/质谱联用技术的代谢物定性 144
7.1　引言 145
7.2　常见有机物质谱裂解规律 148
7.3　GC-MS代谢产物定性方法 150
7.4　LC-MS代谢产物定性方法 157
参考文献 164

第8章　植物脂质组 167
8.1 植物脂质简介 168
8.2 植物脂质的功能 176
8.3 植物脂质碎裂规律 179
8.4 植物脂质组样品制备 181
8.5 脂质组学分析工具 183
8.6 多组学联合分析 189
8.7 展望 190
参考文献 192

第9章　植物代谢网络 197
9.1 引言 198
9.2 植物代谢网络的特征 199
9.3 植物代谢网络的分子生物学研究 206
9.4 存在问题与展望 212
参考文献 213

第10章　LC-MS 在植物代谢组学中的应用 220
10.1 分析样品制备 222
10.2 LC-MS在基因功能研究中的应用 223
10.3 代谢组与基因组重测序数据关联确定候选基因 228
10.4 应用于转基因植物“实质等同性”检测 229
参考文献 233

第11章　NMR 在植物发育和其应答生物/非生物胁迫中的应用 235
11.1 引言 236
11.2 NMR在绿豆种子发育中的应用 236
11.3 NMR在水稻抗虫中的应用 243
11.4　NMR在烟草应答盐胁迫中的应用 251
11.5 机遇与挑战 258
参考文献 258

第12章　代谢组学方法在中药研究中的应用 261
12.1 引言 262
12.2 黄芪药材的多基源鉴别 262
12.3 丹参酮类化合物生物合成途径解析 274
12.4 天麻硫熏综合评估分析 282
参考文献 289

第13章　代谢组数据的深度挖掘及应用 292
13.1 植物代谢组学检测平台 293
13.2 植物代谢组学数据分析方法 298
13.3 植物代谢物注释 306
13.4 植物代谢组学的应用 308
13.5 展望 310
参考文献 311

附录　320
附录1　基于质谱的代谢组学: 注释、定量和*佳报告实践指南 321
附录2　中英文缩略语表 334