棉花纤维发育生物学

前言**章 棉花纤维基因资源与创新 **节 棉花起源与进化 一、棉属的系统分类 二、二倍体棉种的起源与进化 三、四倍体棉种的起源与进化 第二节 棉花纤维基因资源挖掘与创制 一、棉花纤维基因资源创制 二、棉花纤维基因资源挖掘与利用 第三节 棉花遗传连锁图的构建 一、遗传群体的构建 二、分子标记的开发 三、高密度连锁图的构建 参考文献第二章 棉花基因组学研究 **节 植物基因组学研究进展 一、高通量DNA测序技术 二、模式植物基因组研究进展 三、重要农作物基因组学研究进展 第二节 棉花D基因组(雷蒙德氏棉)研究 一、测序、组装与注释 二、古六倍体化事件和全基因组复制 三、转座子扩增与简单序列重复 四、纤维发育、棉酚生物合成相关基因分析 第三节 棉花A基因组(亚洲棉)研究 一、测序、组装与注释 二、A基因组与D基因组比较分析 三、重要农艺性状相关功能基因分析 四、A基因组资源应用前景 参考文献第三章 棉花纤维转录组学研究 **节 转录组学研究技术 一、功能基因组学核心技术 二、基因芯片数据分析技术及相关资源 三、基因表达系列分析技术 四、转录组分析和RNA—Seq 五、棉花eDNA减法技术 第二节 乙烯与纤维发育 一、棉花中参与乙烯合成基因的研究 二、乙烯在棉花纤维伸长过程中起重要作用 三、油菜素内酯对纤维细胞发育的影响及与乙烯的相互作用 第三节 超长链脂肪酸与纤维发育 一、超长链脂肪酸的合成途径及其调控机制研究 二、植物体内超长链脂肪酸功能研究 三、棉花纤维中超长链脂肪酸功能研究 第四节 初生壁合成与纤维发育 一、植物细胞壁的结构与核苷糖代谢 二、棉花纤维中初生壁合成的研究 第五节 次生壁加厚期转录组研究 一、海陆F2群体次生壁加厚期转录组研究 二、海陆BCl群体次生壁加厚期转录组研究 三、次生壁加厚期转录组基因挖掘与分析 参考文献第四章 棉花纤维蛋白质组学研究 **节 棉花纤维蛋白质组学研究新方法 一、棉花纤维总蛋白的酚提取法 二、棉花纤维总蛋白提取方法评价 三、棉花纤维蛋白质组分析技术路线 第二节 长纤维伸长期差异显示蛋白的鉴定与图谱构建 一、长纤维伸长期蛋白质总量的动态变化 二、长纤维伸长期蛋白质组的动态变化 三、长纤维伸长期差异表达蛋白的质谱鉴定 四、长纤维伸长过程中的活跃生化途径 第三节 短纤维起始期差异显示蛋白的鉴定与图谱构建 一、短纤维起始期蛋白质组的动态变化 二、短纤维起始期差异表达蛋白的质谱鉴定 三、短纤维起始期重要蛋白质的动态变化 四、短纤维起始期的差异表达蛋白调控网络 第四节 棉花纤维细胞差异显示磷酸化蛋白质的质谱鉴定 一、棉花纤维伸长过程中差异显示蛋白的磷酸化修饰程度 二、二维电泳凝胶中单个磷酸化蛋白质的质谱鉴定方法 三、磷酸化肽段的预测及其磷酸化位点的质谱鉴定 四、伸长期差异表达磷酸化蛋白质的功能分析 第五节 蛋白质组学分析所揭示的棉花纤维伸长过程中活跃的蛋白质网络 一、碳水化合物代谢相关的蛋白质网络 二、蛋白质代谢相关的蛋白质网络 三、细胞骨架和囊泡运输相关的蛋白质网络图 四、渗透压调控相关的蛋白质网络 参考文献第五章 棉花纤维基因克隆与功能验证 **节 棉花纤维发育重要基因的克隆与功能验证 一、转录因子对棉花纤维发育的调控 二、植物激素对棉花纤维发育的调控 三、功能基因对棉花纤维发育的调控 四、相关基因的克隆与功能鉴定 第二节 棉花纤维表达启动子的克隆和功能验证 一、纤维表达启动子的研究意义和进展 二、棉花源纤维优势表达启动子 三、非棉花源种皮／纤维表达启动子 四、棉花纤维特异／优势表达启动子研究的问题和展望 第三节 转基因技术体系的改良及应用 一、转基因技术体系的改艮 二、时空调控生长素合成基因增加棉花纤维数量 三、转基因优质纤维材料的创制 参考文献第六章 优质高产棉花新品种的分子改良 **节 棉花纤维品质和产量性状的遗传分析方法 一、基于混合线性模型的复合区间作图法 二、基于McIM的多变量QTL分析方法 三、基于MCIM的种子性状QTL分析方法 四、基于MCIM的关联分析方法 五、基于McIM的分析软件开发 第二节 棉花纤维优质高产分子改良的遗传基础 一、棉花纤维品质和产量相关性状的QTL定位 二、棉花种子品质相关性状的QTL定位 三、棉花纤维品质分子标记聚合选择 第三节 棉花抗逆高产分子改良的遗传基础 一、棉花抗衰老功能基因筛选 二、棉花抗旱耐盐性状的遗传分析与基因克隆 三、棉花抗黄萎病相关基因克隆与分析 第四节 优质高产多抗棉花新品种的分子改良 一、陆海渐渗优质材料创制 二、棉花抗旱耐盐新材料创制 三、棉花光敏雄性不育系材料创制 四、棉花抗早衰老材料创制 五、棉花优质高产分子聚合新品种选育 参考文献展望