梅花基因组学研究

前言
第1章 梅花全基因组测序及精细图谱构建
1 材料与方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究结果
2．1 梅花基因组测序策略与原始数据统计
2．2 K-mer分析估算梅花基因组大小
2．3 梅花基因组初步组装
2．4 基因组GC含量分析
2．5 WGM数据辅助基因组组装
2．6 锚定基因组组装序列
2．7 梅花不同器官转录组测序
2．8 梅花全基因组注释
2．9 梅花基因组进化分析
2．10 蔷薇科祖先染色体构建
2．11 梅花花香机制研究
2．12 梅花低温开花机制研究
3 结论
参考文献
附表 部分植物基因组测序

第2章 梅花重要品种重测序与全基因组关联分析
1 材料与方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究结果
2．1 梅花基因组重测序和遗传变异挖掘
2．2 梅花群体遗传学分析
2．3 杏和李的基因渗入
2．4 梅花和李属近缘物种的泛基因组分析
2．5 梅花10个观赏性状的GWAS分析
3 结论
参考文献

第3章 梅花遗传图谱构建与重要性状QTL定位
1 材料与方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究结果
2．1 梅花遗传作图群体构建
2．2 梅花遗传框架图谱构建
2．3 梅花高密度遗传图谱构建与生长性状的QTL定位
2．4 梅花基因组与李属参考图间共线性分析
2．5 梅花高密度遗传图谱及垂枝性状QTL定位
2．6 梅花重要性状定位分析
2．7 梅花垂枝性状精细定位及候选基因筛选
3 结论
参考文献

第4章 梅花花香分子机理研究
1 材料与方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究结果
2．1 李属花香挥发物成分与遗传变异分析
2．2 杏梅和樱李梅特征花香缺失分析
2．3 梅花花香主要挥发性成分时空挥发模式
2．4 ‘三轮玉碟’不同开花时期比较转录组测序分析
2．5 梅花盛花期不同花器官基因表达模式分析
2．6 梅花‘三轮玉碟’花全长转录本测序
2．7 梅花花香调控MYB基因克隆与功能分析
2．8 梅花BAHD家族基因克隆与功能验证
3 结论
参考文献

第5章 梅花花发育分子机理研究
1 材料与方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究结果
2．1 梅花花发育sRNA转录组及miRNA表达分析
2．2 梅花休眠相关DELLA基因克隆与功能分析
2．3 梅花花器官发育相关MADS-box基因功能分析
3 结论
参考文献

第6章 梅花花色分子机理研究
1 材料与方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究结果
2．1 梅花花色表型测定
2．2 梅花花青素苷成分鉴定
2．3 梅花花青素苷定量分析
2．4 梅花花青素苷组成与花色参数关系分析
2．5 梅花R2R3-MYB基因家族分析
2．6 梅花R2R3-MYB基因功能分析
3 结论
参考文献

第7章 梅花抗寒分子机理研究
1 材料与方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究结果
2．1 梅花PmICE1基因功能分析
2．2 梅花PmLEA基因功能分析
2．3 梅花PmDAM和PmCBF基因功能分析
3 结论
参考文献