白桦木材形成及分子调控

第1章 白桦形成层表达谱分析及相关基因季节调控 1.1 引言 1.1.1 木材形成的生物学过程及其基因调控 1.1.2 木材形成的EST分析研究方法 1.1.3 本研究的内容和技术路线 1.2 白桦形成层cDNA文库的构建 1.2.1 材料与方法 1.2.2 文库构建及质量分析 1.2.3 小结 1.3 白桦形成层基因表达分析 1.3.1 材料与方法 1.3.2 文库的基本特征 1.3.3 序列同源比较及功能分类 1.3.4 4个物种形成区域文库数据比较 1.3.5 白桦木材形成相关基因及分类 1.3.6 白桦形成层表达相关基因文库特征分析 1.3.7 小结 1.4 白桦木材形成相关基因季节性表达分析 1.4.1 材料与方法 1.4.2 基因表达分析 1.4.3 白桦木材形成相关基因季节性表达特征分析 1.4.4 小结 1.5 编码区全长基因的生物信息学分析 1.5.1 材料与方法 1.5.2 木材形成相关基因生物信息学特征 1.5.3 小结 第2章 白桦茎初生向次生转变的分子调控 2.1 引言 2.2 白桦初生和次生茎发育解剖学分析 2.2.1 材料与方法 2.2.2 白桦初生和次生茎发育解剖学特征 2.2.3 小结 2.3 白桦初生和次生茎发育数字基因表达谱构建及调控分析 2.3.1 材料与方法 2.3.2 测序质量评估分析 2.3.3 差异表达基因的分析 2.3.4 差异表达基因qRT-PCR分析 2.3.5 层次聚类分析 2.3.6 GO功能分析 2.3.7 细胞扩展和伸长相关基因的研究 2.3.8 生长激素相关基因参与初生和次生茎发育的研究 2.3.9 茎发育相关转录因子的研究 2.3.10 类受体蛋白激酶调节茎发育的功能研究 2.3.11 参与木质素生物合成途径的关键酶基因表达分析 2.3.12 纤维素合成相关酶类分析 2.3.13 细胞壁修饰相关基因的分析 2.3.14 小结 第3章 激素处理及施肥对白桦木质部发育及材性的影响 3.1 引言 3.2 施肥对白桦材性性状影响分析 3.2.1 材料与方法 3.2.2 施肥对生长性状的分析 3.2.3 施肥对木质素和纤维素含量的影响 3.2.4 纤维长宽的分析 3.2.5 施肥对导管的影响 3.2.6 木材基本密度及微纤丝角分析 3.2.7 小结 3.3 激素处理对白桦木质部发育及细胞壁形成相关基因表达调控的影响 3.3.1 材料与方法 3.3.2 白桦种子发芽分析 3.3.3 白桦幼苗生长与次生木质部发育分析 3.3.4 白桦SCW基因的序列特征及系统发育分析 3.3.5 赤霉素处理下SCW基因表达模式分析 3.3.6 小结 第4章 白桦应拉木形成及分子调控 4.1 引言 4.1.1 应力木系统的研究 4.1.2 转录组测序技术及其在应力木研究中的应用 4.1.3 蛋白质组学技术及其在应力木研究中的应用 4.1.4 代谢组学研究技术及其在应力木研究中的应用 4.2 白桦木质部响应重力刺激的转录组学分析 4.2.1 材料与方法 4.2.2 应拉木化学组分及解剖学分析 4.2.3 RNA质量检测 4.2.4 测序数据产量和组装结果 4.2.5 unigene的功能注释 4.2.6 转录组中的高丰度unigene 4.2.7 差异表达基因的鉴定 4.2.8 FLA基因的表达分析 4.2.9 LTP基因的表达分析 4.2.10 莽草酸、苯丙素和木质素单体生物合成途径基因表达分析 4.2.11 生长激素相关基因表达分析 4.2.12 Solexa基因表达谱qRT-PCR验证 4.2.13 小结 4.3 白桦木质部蛋白提取方法的建立 4.3.1 材料与方法 4.3.2 不同方法提取的蛋白质得率比较 4.3.3 不同提取方法的单向电泳（1-DE）图谱分析 4.3.4 不同提取方法的双向电泳（2-DE）图谱分析 4.3.5 木质部蛋白提取方法的综合分析 4.3.6 小结 4.4 白桦分生木质部响应重力的蛋白质组学分析 4.4.1 材料与方法 4.4.2 白桦TW、OW、NW的生长表型 4.4.3 白桦TW、OW和NW木质部蛋白质量检测 4.4.4 原始数据分析和蛋白质鉴定结果 4.4.5 差异表达蛋白的鉴定 4.4.6 差异表达蛋白的功能注释 4.4.7 多糖代谢途径和纤维素合成途径相关蛋白分析 4.4.8 苯丙氨酸和酪氨酸代谢相关蛋白与苯丙素和木质素生物合成分析 4.4.9 柠檬酸循环相关蛋白分析 4.4.10 小结 4.5 白桦木质部响应人工弯曲处理和重力刺激的代谢组学分析 4.5.1 材料与方法 4.5.2 白桦木质部响应重力信号和人工弯曲刺激的代谢物鉴定 4.5.3 白桦木质部响应重力信号和人工弯曲刺激的差异代谢物分析 4.5.4 白桦木质部响应人工弯曲刺激的代谢谱分析 4.5.5 小结 参考文献