包邮蛋白质组学实验技术精编

第1章 蛋白质组学概论1.1 蛋白质组学研究的背景1.2 蛋白质组学的分类1.3 蛋白质组学的主要应用1.4 蛋白质组学的研究策略1.5 蛋白质组技术的*新进展1.5.1 定量蛋白质组研究策略1.5.2 串联多维分离策略1.5.3 蛋白质磷酸化分析策略1.5.4 蛋白质复合体分析策略1.5.5 细胞器蛋白质组分析策略1.5.6 生物标志物的质谱验证策略1.6 发展趋势参考文献第2章 双向电泳实验设计与统计分析2.1 统计学方法简述2.2 实验设计2.2.1 基本方法2.2.2 含区组因素的双向电泳实验设计2.2.3 如何合理进行随机化分组参考文献第3章 双向凝胶电泳3.1 样品制备3.1.1 基本概念与原则3.1.2 实验方案范例3.1.3 常见问题与解析3.2 蛋白质定量3.2.1 BCA法3.2.2 Bradford法3.3 **向等电聚焦（IEF）3.3.1 IPG胶条、IPG缓冲液与水化液3.3.2 上样3.3.3 常见问题3.4 第二向SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳3.4.1 SDSPAGE凝胶的灌制3.4.2 胶条的平衡与转移3.4.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳3.4.4 常见问题3.5 凝胶的染色3.5.1 蛋白质组学实验中聚丙烯酰胺凝胶的考马斯亮蓝染色3.5.2 蛋白质银染色法3.5.3 二价锌离子负染法3.5.4 糖蛋白的检测3.6 转印3.6.1 半干转印3.6.2 垂直槽转印3.6.3 丽春红染色3.6.4 常见问题3.7 胶内酶解3.7.1 实验步骤3.7.2 常见问题3.8 差异荧光表达分析系统3.8.1 实验步骤3.8.2 常见问题3.9 BlueNativePAGE电泳3.9.1 实验步骤3.9.2 常见问题参考文献第4章 MALDITOF质谱技术与问题解析4.1 MALDITOF质谱简介4.1.1 MALDITOF质谱仪4.1.2 MALDI的基质4.1.3 MALDITOF质谱基本操作4.2 肽质量指纹谱技术4.3 PSD或TOF/TOF肽序列标签技术4.4 临床蛋白质组学技术4.4.1 原位蛋白质组学4.4.2 液体蛋白质芯片与血清多肽组学4.5 MALDI质谱仪器的维护与注意事项4.5.1 日常仪器维护4.5.2 样品检测注意事项4.6 常见问题分析参考文献第5章 纳升电喷雾串联质谱技术与问题解析5.1 电喷雾串联质谱简介5.1.1 电喷雾电离基本原理5.1.2 电喷雾质谱的特点5.2 多肽测序与蛋白质鉴定5.2.1 多肽测序5.2.2 蛋白质鉴定5.3 无标记定量蛋白质组研究5.3.1 基本原理5.3.2 基于质谱峰强度的定量方法的一般步骤5.3.3 应用实例5.4 蛋白质磷酸化分析5.4.1 前言5.4.2 磷酸化蛋白质的分离和检测5.4.3 磷酸肽的分离5.5 离子淌度质谱及其应用5.5.1 基本原理5.5.2 在蛋白质组研究中的典型应用5.5.3 展望5.6 多维色谱串联质谱联用技术5.6.1 基于多维色谱分离的蛋白质组研究基本原理5.6.2 主要应用及需要解决的关键问题5.6.3 展望5.7 常规操作、仪器维护与注意事项5.7.1 QTOF质谱仪的日常操作（Waters公司）5.7.2 Qstar（AB公司）5.7.3 BrukerHCT电喷雾质谱仪的基本操作规程5.8 常见问题解析参考文献第6章 蛋白质组数据分析技术6.1 生物信息学简介6.2 蛋白质组数据库6.3 双向电泳数据库6.4 生物信息学网站与工具软件6.5 MOWSE算法与结果评估6.6 蛋白质鉴定与数据库检索方法（Mascot）6.6.1 Mascot检索参数6.6.2 数据文件格式6.6.3 肽的裂解6.6.4 序列查询6.6.5 查询结果解析6.7 PMF与MS/MS数据组合查库方法6.7.1 操作流程6.7.2 结果示例6.8 串联质谱数据搜库结果质量控制方法6.8.1 串联质谱数据搜库结果质量控制的研究现状和问题6.8.2 结果数据集的质量评价参数6.8.3 搜库参数优化6.8.4 展望6.9 Mascot的安装与使用简介6.10 常见问题解析参考文献