基因定位与育种设计

前言
第1章 遗传研究群体
  1.1  遗传研究的常见群体类型
    1.1.1  双亲群体
    1.1.2  多亲群体
    1.1.3  创建遗传群体的若干注意事项
  1.2  基因型数据的初步整理和分析
    1.2.1  基因型数据的获取
    1.2.2  基因频率和基因型频率
    1.2.3  基因型频率的适合性检验
  l.3  基因效应和遗传方差
    1.3.1  群体均值和表型方差的计算
    1.3.2  单基因座位上的加显性遗传模型
    1.3.3  单基因座位上的遗传方差
  1.4  单环境表型观测值的方差分析
    1.4.1  表型值的线性分解
    1.4.2  表型离差平方和的分解
    1.4.3  水稻粒长性状的单环境方差分析
  1.5  多环境表型观测值的方差分析
    1.5.1  表型值的线性分解
    1.5.2  表型离差平方和的分解
    1.5.3  水稻粒长的多环境方差分析
  1.6  基因型值和遗传力的估计
    1.6.1  单环境基因型值和遗传力的估计
    1.6.2  多环境基因型值和遗传力的估计
    1.6.3  异质误差方差下基因型值的估计
  练习题
第2章 连锁分析和遗传图谱构建
  2.1  世代转移矩阵
    2.1.1  世代转移矩阵的定义
    2.1.2  回交世代转移矩阵
    2.1.3  自交世代转移矩阵
    2.1.4  加倍单倍体世代转移矩阵
    2.1.5  连续自交的世代转移矩阵
    2.1.6  基因型理论频率的矩阵表示
§2.2  两个座位上各种基因型的理论频率
    2.2.1  10种基因型的理论频率
    2.2.2  永久群体中4种纯合基因型的理论频率
    2.2.3  两个共显性标记在暂时群体中的基因型理论频率
    2.2.4  一个共显性和一个显性标记在暂时群体中的基因型理论频率
    2.2.5  一个共显性和一个隐性标记在暂时群体中的基因型理论频率
    2.2.6  两个显性标记在暂时群体中的基因型理论频率
    2.2.7  一个显性和一个隐性标记在暂时群体中的基因型理论频率
    2.2.8  两个隐性标记在暂时群体中的基因型理论频率
§2.3  两个标记／基因座位间重组率的估算一
    2.3.1  dh群体中重组率的极大似然估计
    2.3.2  重组率极大似然估计的一般形式
    2.3.3  f2群体中一个共显性座位和一个显性座位间的重组率估计
    2.3.4  newton迭代算法中初始值的选取
    2.3.5  f2群体中重组率估计的em算法
    2.3.6  奇异分离对重组率估计的影响
  2.4  不同遗传群体重组率估计的比较研究
    2.4.1  不同遗传群体中检验连锁的lod统计量
    2.4.2  不同遗传群体中重组率估计的准确度
    2.4.3  不同遗传群体检测到显著连锁所需的样本量
  2.5  作图函数和遗传图谱构建
    2.5.1  遗传干涉和干涉系数
    2.5.2  作图函数
    2.5.3  标记分群算法
    2.5.4  标记排序算法
  2.6  随机交配群体的连锁分析
    2.6.1  随机交配与连锁不平衡
    2.6.2  基因型到配子的转移矩阵
    2.6.3  随机交配若干代的配子型和基因型频率
  练习题
第3章 单标记分析和简单区间作图
  3.1  单标记分析
    3.1.1  单标记基因型均值的差异分析
  ……
第4章 完备区间作图方法
第5章 互作qtl作图
第6章 其他类型群体的基因定位
第7章 qtl作图中的其他常见问题
第8章 育种过程的建模和模拟
第9章 育种方法的模拟和比较
第10章 育种中的预测和设计
参考文献
中英文名词对照和索引
图版