- ISBN:9787030406736
- 装帧:一般胶版纸
- 册数:暂无
- 重量:暂无
- 开本:16开
- 页数:183
- 出版时间:2014-06-01
- 条形码:9787030406736 ; 978-7-03-040673-6
本书特色
本书几乎涵盖了 ngs技术在生命科学领域的全部应用,包括从头测序 (含基因组注释)、针对稀有变异检测和元基因组研 究的扩增子测序、染色 质免疫共沉淀测序(chip—seq)、rna测序(rna— seq)和肿瘤体细胞变异 检测(包括单碱基替换、插入、缺失和易位)等。通 过广泛使用的一线软 件充分讨论数据分析方法,详述*优工作流程(包括 部分学习指南),实用 性强、可靠性强、专业指导性强。 本书非常适用于从事生命科学研究的研究生和青 年学者。他们不仅可 以在这里了解到不同软件的详细使用方法和参数设置 ,还可以在作者提供 的软件评估和优化流程的基础上找到自身研究项目所 需的第二代测序信息 处理的*佳解决方案。
内容简介
《第二代测序信息处理》几乎涵盖了NGS 技术在生命科学领域的全部应用,包括从头测序(含基因组注释)、针对稀有变异检测和元基因组研究的扩增子测序、染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)、RNA 测序(RNA-seq)和肿瘤体细胞变异检测(包括单碱基替换、插入、缺失和易位)等。通过广泛使用的一线软件充分讨论数据分析方法,详述*优工作流程(包括部分学习指南),实用性强、可靠性强、专业指导性强。
目录
译者前言
前言
1 dna测序简介
2 测序信息学的历史
3 第二代测序数据的可视化
4 dna序列比对
5 用广义de bruijn有向图算法组装基因组
6 用短序列读段从头组装细菌基因组
7 基因组注释
8 使用第二代测序技术检测序列变异
9 chip—seq
10 使用第二代测序进行rna测序
11 元基因组学
12 dna测序信息学中的高性能计算
术语表
索引
彩图
作者简介
Stuart M.Brown是纽约大学医学院细胞生物学系助理教授、卫生信息学和生物信息学中心高级教职人员,同时是生物信息学咨询小组营运总监,也是序列信息学小组组长。他在纽约大学教授了12年生物信息学研究生课程,是生物信息学和医学基因组学教材的作者。Brown博士在康奈尔大学获得分子生物学博士学位。
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