微生物生态学导论-(第二版)

**章 生态学与微生物生态学
**节 生态学
一、生态学的定义
二、生态学的研究内容
三、生态学的分类
四、生态学的发展
第二节 微生物生态学
一、微生物生态学的定义
二、微生物生态学的研究范畴和方法
三、微生物生态学的任务
四、微生物生态学的发展
五、微生物生态学与其他学科的关系

第二章 微生物生态学的基本原理
**节 环境与微环境
一、环境
二、生境
三、生态位
四、微环境
五、表面环境
第二节 生物圈和生态系统
一、生物圈
二、生态系统
三、微生物生态系统
第三节 生态系统的功能
一、物种流
二、能量流
三、食物链
四、营养级
五、信息流

第三章 自然界中的微生物及其多样性
**节 微生物在土壤中的分布
一、土壤的形成
二、土壤的环境条件
三、土壤中微生物的生态分布
第二节 微生物在水体中的分布
一、清水型水生微生物与腐败型水生微生物
二、淡水微生物和海水微生物
三、水中微生物的作用
四、水中的微生物与饮用水
第三节 微生物在大气中的分布
第四节 工农业产品中的微生物
一、粮食和食品中的微生物
二、肉类上的微生物
三、鱼类上的微生物
四、乳制品中的微生物
五、工业材料及其制品中的微生物
第五节 生物圈中的第四大生命域

第四章 **环境中的微生物
**节 嗜热微生物和嗜冷微生物
一、嗜热微生物
二、嗜冷微生物
第二节 嗜酸微生物和嗜碱微生物
一、嗜酸微生物
二、嗜碱微生物
第三节 其他嗜极微生物
一、嗜盐微生物
二、嗜压微生物
三、抗辐射微生物
四、太空微生物
第四节 嗜极微生物的开发利用

第五章 微生物种群增长及其相互作用
**节 种群的基本概念
一、种群的定义
二、种群密度-
三、种群的相互作用
第二节 种群增长
一、微生物在封闭环境内的增长
二、微生物在开放环境内的增长
第三节 种群之间的相互作用
一、相互作用的基本类型
二、种群之间竞争的动力学原理

第六章 微生物群落发展与演替
**节 群落的基本概念
一、群落定义
二、群落形成
第二节 群落的主要特征
一、种多样性
二、垂直结构
三、优势种
四、群落生境
第三节 群落的发展和演替
一、微生物种群的适应作用和自然选择
二、微生物群落的发展
三、微生物群落的演替

第七章 微生物与生物地球化学循环
**节 有机物的微生物降解
一、微生物在生态系统中的作用
二、有机物降解的重要性
第二节 碳素循环
一、含碳化合物的主要来源
二、碳在食物网中的转移
三、生境中的碳循环
四、自然多聚物的微生物降解
五、微生物与全球性的碳循环
第三节 氮素循环
一、硝化作用
二、硝酸还原作用和反硝化作用
三、固氮作用
四、环境和农业活动对氮素循环的影响
第四节 其他元素的循环
一、氧循环
二、氢循环
三、硫循环
四、磷循环
五、铁循环
六、硅循环

第八章 环境因子对微生物的影响
**节 营养因子对微生物的影响
一、*小量定律
二、营养因子及其生理作用
第二节 物理因子对微生物的影响
一、温度
二、水分活度
三、渗透压
四、辐射
五、超声波
六、微波
七、压力
第三节 化学因子对微生物的影响
一、pH-
二、Eh
三、化学物质

第九章 微生物与动植物的相互关系
**节 微生物与植物之间的相互关系
一、植物表面微生物
二、植物与微生物的共生体
三、微生物引起的植物病害
第二节 微生物与动物之间的相互关系
一、微生物与昆虫的共生
二、瘤胃共生
三、发光细菌和海洋鱼类的共生
四、光合微生物与无脊椎动物的共生
五、动物与微生物的捕食关系
六、动物致病的某些生态学问题
第三节 微生物与人体之间的相互关系
一、微生物与皮肤健康
二、微生物与口腔健康
三、微生物与胃肠道健康
四、身体其他部位的正常菌群与健康
五、病原体人侵的相关生态学问题

第十章 微生物生态学研究的方法和技术
**节 经典方法和技术
一、样品的采集、富集培养和微生物的纯培养的分离
二、显微计数法和荧光染色直接计数法
三、*大近似值法
四、活菌计数法
第二节 生理生化方法
一、Biolog微平板法
二、PLFA谱图分析
第三节 分子生物学方法
一、（G+C）摩尔百分含量
二、核酸探针杂交技术
三、DNA-DNA杂交
四、基于PCR的指纹图谱分析
五、DNA序列分析
六、基因芯片
七、宏基因组学
第四节 人类微生物组计划

第十一章 微生物分子生态学
**节 微生物分子生态学的由来
一、自然种群结构鉴定的普遍性问题
二、利用遗传信息鉴定微生物种群的可行性
第二节 自然种群鉴定的策略
一、单细胞的直接鉴定
二、从自然样品中抽提细胞
三、从自然样品中直接抽提核酸
第三节 微生物分子生态学研究方法的优势和不足
一、微生物分子生态学研究方法的优势
二、微生物分子生态学研究方法的不足
三、展望

第十二章 微生物生态学的应用
**节 农业微生物生态学及其应用
一、作物根系环境的微生物区系
二、土壤微生物的生态功能
第二节 医学微生物生态学及其应用
一、口腔微生物与人类健康
二、胃肠道微生物与人体健康
三、呼吸道微生物与人类健康
四、泌尿生殖道微生物与人类健康
五、皮肤微生物与人类健康
第三节 水生微生物生态学及其应用
一、水体基本特性
二、水体中的微生物区系
三、水体微生物的作用

第十三章 微生态学与微生态制剂
**节 微生态学的概念
第二节 微生态学的创立与发展
第三节 正常微生物群及其与宿主的关系
一、正常微生物群
二、正常微生物群与人和动物的关系
第四节 微生态学与微生态制剂
一、微生态制剂的含义和类型
二、微生态制剂的作用机制
三、展望

主要参考文献