现代科研指北

第 1 章 现代科研 1 1.1 科学知识的五个层次 2 1.1.1 背景层 2 1.1.2 已知的已知层 3 1.1.3 已知的未知层 4 1.1.4 未知的已知层 4 1.1.5 未知的未知层 5 1.2 知识体系的构建 6 1.3 认知偏误 7 第 2 章 科研现状概览 11 2.1 现代社会 12 2.1.1 现代社会的形成 12 2.1.2 现代社会的结构 19 2.1.3 现代科研的定位 26 2.2 研究生教育 29 2.2.1 研究生蓄水池 29 2.2.2 毕业延期问题 33 2.2.3 学术职业路径 37 2.2.4 全栈科学家 40 2.2.5 论文八股化 42 2.3 可重复性危机 43 2.3.1 零假设显著性检验 43 2.3.2 规律性 52 2.3.3 可重复性研究 57 2.4 “掠夺性”期刊 59 2.5 公众科学 61 2.6 科普 62 第 3 章 思维工具 64 3.1 科学哲学 65 3.1.1 古希腊 66 3.1.2 中世纪 67 3.1.3 文艺复兴之后 68 3.1.4 逻辑实证主义 70 3.1.5 否证主义 71 3.1.6 历史主义 72 3.1.7 无政府主义 73 3.1.8 实用主义 74 3.1.9 其他 74 3.2 数学思维 75 3.3 统计思维 78 3.3.1 抽象 78 3.3.2 似然度 79 3.3.3 回归 80 3.3.4 因果 84 3.3.5 残差 96 3.4 模型思维 97 3.4.1 编程 97 3.4.2 决策模型 103 3.4.3 个体 - 整体模型 104 3.4.4 动力学模型 111 3.5 启发法 112 第 4 章 实验 115 4.1 思想实验 117 4.2 仿真实验 122 4.3 观察实验 123 4.4 控制实验 124 4.5 因素选择 125 4.6 效应指标 126 4.7 采样与样品预处理 128 4.8 预实验 129 4.9 质量保证 / 质量控制 136 第 5 章 数据处理 139 5.1 探索性数据分析 140 5.2 统计推断 145 5.3 线性模型 162 5.4 模型组合 167 5.5 计算方法 169 5.5.1 并行计算 169 5.5.2 容器技术 170 5.5.3 云 171 5.6 主成分分析 171 6 章 文献 179 6.1 文献管理 180 6.1.1 从无到有 180 6.1.2 从有到精 181 6.1.3 从精到用 183 6.2 文本挖掘 185 6.2.1 关键词 185 6.2.2 作者 192 6.3 全学科评价 193 6.4 荟萃分析 196 第 7 章 学术生活 199 7.1 学术道德与伦理 200 7.1.1 剽窃 200 7.1.2 文章挂名 201 7.1.3 双重发表 202 7.1.4 数据造假 202 7.1.5 有害研究实践 202 7.1.6 合规性 203 7.1.7 性骚扰 203 7.1.8 歧视 203 7.1.9 伦理 204 7.2 邮件 205 7.3 学术出版 206 7.3.1 期刊 / 论文 206 7.3.2 会议摘要 212 7.3.3 专著 213 7.3.4 专利 213 7.3.5 软件 214 7.4 学术会议 214 7.4.1 口头报告 214 7.4.2 海报报告 216 7.4.3 电梯报告 216 7.4.4 听报告 217 7.4.5 主持报告 217 7.5 审稿 217 7.6 学术合作 219 7.7 利益冲突 220 7.7.1 数据共享 220 7.7.2 社交网络 221 7.8 学术评价 221 7.9 课题组管理 223 7.9.1 课题组规章（示例） 223 7.9.2 实验室规章（示例） 226 7.9.3 项目管理 227 7.9.4 经费管理 230 7.9.5 心理辅导 232 7.10 讲课 233 7.10.1 了解学生如何学习 233 7.10.2 如何激励学生 233 7.10.3 评价学习 234 7.10.4 课程设计 234 7.10.5 互动学习 235 7.10.6 教学理念 235 第 8 章 就业 236 8.1 商业与学术 237 8.2 简历 238 8.3 人脉 239 8.4 面试 241 8.5 职场 243 8.6 职业 244 8.6.1 博士后 244 8.6.2 常任轨 245 8.6.3 非常任轨 245 8.6.4 非高等教育 246 8.6.5 科学顾问 246 8.6.6 科学传播 247 8.6.7 政府公务员 248 8.6.8 非营利组织与基金会 248 8.6.9 编辑 / 出版社 249 8.6.10 应用专家及销售 249 8.6.11 企业科研 / 药企 250 8.6.12 医药交流 250 8.6.13 咨询 250 8.6.14 金融 251 8.6.15 数据科学家 251 8.6.16 创业 252 附录 A 现代科研兵刃谱 253 附录 B 全栈科学家自测题 263 附录 C 科学问题 268