分子生态学与数据分析基础

前言**部分  分子生态学理论  **章  分子生态与遗传变异    **节  遗传变异的产生    第二节  分子标记的种类    第三节  遗传变异的衡量    第四节  遗传变异的维持、丧失前言**部分  分子生态学理论  **章  分子生态与遗传变异    **节  遗传变异的产生    第二节  分子标记的种类    第三节  遗传变异的衡量    第四节  遗传变异的维持、丧失  第二章  分子生态学研究内容    **节  个体与物种区分、鉴定（差异与多样性）    第二节  基因流和适应    第三节  小种群第二部分  分子生态数据获得与分析——以微卫星体分子标记为例  第三章  分子遗传标记的获得——微卫星体    **节  微卫星体获得：msatcommander、ingap、microtfamily和gelquest软件    第二节  微卫星体数据初步整理分析：genalex软件及其遗传多样性大小衡量  第四章  遗传变异状况    **节  hardy-weinberg平衡检测：genepop、sgof+软件    第二节  连锁不平衡检测：genepop软件    第三节  等位基因丰富度比较：adze软件  第五章  遗传分化    **节  fst分析：genetix软件    第二节  amova分析：genaiex软件  第六章  分组分析    **节  structure软件分析及convert、structure harvester、clumpp软件    第二节  tess软件分析及past、tess ad-mixer软件  第七章  空间遗传结构分析    **节  spca分析    第二节  alleles in space和surfer软件    第三节  空间自相关分析：spagedi软件    第四节  空间遗传结构的异向性：passage软件和r程序  第八章    景观遗传学分析    **节  表面距离：arcgis软件    第二节  加权线性距离、*小成本距离和阻抗距离：r程序    第三节  mantel test和partial mantel test：passage软件参考文献