计算生物学导论-图谱.序列和基因组-5-生物数学丛书

《生物数学丛书》序前言数学符号 第0章 引言0．1 分子生物学0．2 数学，统计和计算机科学第1章 分子生物学一些知识1．1 DNA和蛋白1．1．1 双螺旋结构1．2 中心定理1．3 遗传密码1．4 转化RNA和蛋白序列1．5 基因不简单1．5．1 开始与停止1．5．2 基因表达的控制1．5．3 割裂基因1．5．4 跳跃基因1．6 生物化学问题第2章 限制图谱2．1 引言2．2 图2．3 区间图2．4 片段大小的度量问题第3章 多重图谱3．1 双消化问题3．1．1 双消化问题的多重解3．2 多重解分类3．2．1 反射性3．2．2 重叠等价3．2．3 重叠尺寸等价3．2．4 更多的图论知识3．2．5 从一条路到另一条路3．2．6 限制图谱及边界块图3．2．7 限制图谱的盒变换3．2．8 -个例子问题第4章 求解DDP的算法4．1 算法和复杂性4．2 DDP是NP完全的4．3 解DDP的方法4．3．1 整数规划4．3．2 划分问题4．3．3 TSP4．4 模拟退火法：TSP和DDP4．4．1 模拟退火法4．4．2 TSP4．4．3 DDP4．4．4 环状图谱4．5 用真实数据作图4．5．1 使数据符合图4．5．2 图谱算法问题第5章 克隆与克隆文库5．1 有限的随机克隆数5．2 完全消化的文库5．3 部分消化的文库5．3．1 可克隆基的组分5．3．2 采样、方法15．3．3 设计部分消化文库5．3．4 Poisson近似5．3．5 获得所有片段5．3．6 *大表达度5．4 每个微生物中的基因组…… 第6章 物理基因组图谱：海洋、岛屿和锚第7章 序列装配第8章 数据库和快速序列装配第9章 动态规划、两个序列比对第10章 多重序列比对第11章 序列比对用到的概率和统计第12章 有关序列模式的概率与统计第13章 RNA二级结构第14章 树和序列第15章 来源与展望 参考文献附录 问题解答和提示索引