化学生物学

第 1 章 化学生物学基础（The Fundamentals of Chemical Biology） 1 1.1 分子生物学中心法则（The Central Dogma of Molecular Biology） 2 1.2 基因（Genes） 3 1.3 基因组（Genomes） 5 1.4 基因组以外的生物多样性来源（Sources of Diversity Beyond Genomes） 9 1.5 组装产生的多样性（Combinatorial Assembly Generates Diversity） 11 1.6 一些常见的化学生物学工具（Some Common Tools of Chemical Biology） 15 1.7 总结（Summary） 23 第 2 章 生物体的化学起源（The Chemical Origins of Biology） 25 2.1 电子转移机理是分子轨道理论的一种表达形式（Mechanistic Arrow-Pushing is an Expression of Molecular Orbital Theory） 25 2.2 氢键和质子转移（Hydrogen Bonds and Proton Transfers） 30 2.3 前生命化学（Prebiotic Chemistry） 34 2.4 非键相互作用（Nonbonding Interactions） 39 2.5 模块化设计的魅力（The Power of Modular Design） 44 2.6 总结（Summary） 48 第 3 章 DNA 53 3.1 DNA的结构形式（Forms of DNA） 54 3.2 DNA的核糖核酸亚基（The Ribonucleotide Subunits of DNA） 55 3.3 DNA中的基本作用力（Elementary Forces in DNA） 59 3.4 DNA超结构（DNA Superstructure） 67 3.5 聚合酶介导的DNA生物合成（The Biological Synthesis of DNA by Polymerase Enzymes） 72 3.6 DNA的化学合成（The Chemical Synthesis of DNA） 76 3.7 DNA分子的电泳分离（Separation of DNA Molecules by Electrophoresis） 85 3.8 DNA重组技术（Recombinant DNA Technology） 90 3.9 核酸光化学（Nucleic Acid Photochemistry） 95 3.10 DNA作为细胞毒性药物的靶标（DNA as a Target for Cytotoxic Drugs） 97 3.11 总结（Summary） 113 第 4 章 RNA 119 4.1 RNA的结构（RNA Structure） 120 4.2 RNA的合成（RNA Synthesis） 126 4.3 转录调控（Transcriptional Control） 128 4.4 真核生物的mRNA加工（mRNA Processing in Eukaryotes） 135 4.5 RNA的受控降解（Controlled Degradation of RNA） 139 4.6 mRNA被核糖体翻译成蛋白质（Ribosomal Translation of mRNA into Protein） 142 4.7 从寡核苷酸库到蛋白质库（From Oligonucleotide Libraries to Protein Libraries） 156 4.8 总结（Summary） 159 第 5 章 多肽和蛋白质的结构（Peptide and Protein Structure） 163 5.1 氨基酸和多肽（Amino Acids and Peptides） 164 5.2 固相多肽合成（Solid-Phase Peptide Synthesis） 169 5.3 决定蛋白质二级结构的基本作用力（Fundamental Forces that Control Protein Secondary Structure） 181 5.4 二硫键交联的化学（The Chemistry of Disulfide Crosslinks） 188 5.5 蛋白质结构域的结构和功能（Protein Domains Have Structural and Functional Roles） 191 5.6 *高层级的蛋白质结构（Higher Levels of Protein Structure） 200 5.7 总结（Summary） 201 第 6 章 蛋白质功能（Protein Function） 209 6.1 受体-配体相互作用（Receptor-Ligand Interactions） 210 6.2 从定量角度认识酶功能（A Quantitative View of Enzyme Function） 216 6.3 多步反应酶催化机制（A Mechanistic View of Enzymes that Catalyze Multistep Reactions） 219 6.4 有机辅酶因子（Enzymes that Use Organic Cofactors） 240 6.5 蛋白质工程改造（Engineering Improved Protein Function） 245 6.6 总结（Summary） 251 第 7 章 糖生物学（Glycobiology） 255 7.1 结构（Structure） 255 7.2 糖苷键的化学和酶学（The Chemistry and Enzymology of the Glycosidic Bond） 260 7.3 多糖（Polysaccharides） 269 7.4 糖蛋白（Glycoproteins） 272 7.5 糖脂（Glycolipids） 286 7.6 细胞内的糖基化（Glycosylation in the Cytosol） 288 7.7 寡糖的化学合成（Chemical Synthesis of Oligosaccharides） 290 7.8 与糖配体结合的蛋白质（Proteins that Bind to Carbohydrate Ligands） 293 7.9 葡萄糖稳态与糖尿病（Glucose Homeostasis and Diabetes） 301 7.10 总结（Summary） 306 第 8 章 聚酮和萜类（Polyketides and Terpenes） 309 8.1 聚酮生物合成中的克莱森反应（The Claisen Reaction in Polyketide Biosynthesis） 310 8.2 聚酮生物合成范例：脂肪酸生物合成（The Biosynthesis of Fatty Acids is a Paradigm for Polyketides Biosynthesis） 312 8.3 人源聚酮的生物学功能（The Biological Role of Human Polyketides） 317 8.4 非人源聚酮类天然产物（Nonhuman Polyketides Natural Products） 330 8.5 非核糖体肽合成酶（Nonribosomal Peptide Synthases） 337 8.6 人源萜类（Human Terpenes） 338 8.7 非人源萜类天然产物（Nonhuman Terpene Natural Products） 351 8.8 小结（Summary） 358 第 9 章 信号转导的化学调控（Chemical Control of Signal Transduction） 363 9.1 信号转导（Singal Transduction） 365 9.2 人体细胞中的信号通路概述（An Overview of Signal Transduction Pathways in Human Cells） 369 9.3 核受体（Nuclear Receptors） 372 9.4 与转录因子直接相互作用的细胞表面受体（Cell-Surface Receptors that Interact Directly with Transcription Factors） 380 9.5 受体酪氨酸激酶（Receptor Tyrosine Kinases） 385 9.6 G蛋白偶联受体（G Protein-Coupled Receptors，GPCR） 395 9.7 离子通道受体（Ion Channel Receptors） 408 9.8 三聚化死亡受体（Trimeric Death Receptors） 414 9.9 气体小分子信号转导通路（Pathways Controlled by Small Diffusible Gas Molecules） 416 9.10 总结（Summary） 418