计算机在材料和化学中的应用(张发爱)

第1章 计算机系统及其在材料科学中的应用1 1.1 计算机信息系统1 1.2 计算机辅助系统1 1.2.1 计算机辅助设计1 1.2.2 计算机辅助制造2 1.2.3 计算机辅助工艺规划2 1.3 计算机控制系统2 1.4 计算机仿真（模拟）技术3 1.4.1 计算机模拟技术的优势3 1.4.2 材料模拟方法与模拟层次4 1.4.3 材料研究的主要模拟技术4 1.4.4 计算机模拟在材料科学中的应用5 1.4.5 计算机模拟在高分子材料科学中的应用7 1.5 计算机数据和图像处理技术8 1.6 计算机模拟的步骤8 1.7 结束语9 参考文献9 第2章 化学中的常用计算机软件与资源10 2.1 化学结构式10 2.2 三维结构10 2.3 数据处理11 2.4 文献管理13 2.5 图谱解析13 2.6 计算机辅助教学13 2.7 量子化学计算14 参考文献15 第3章 化学制图软件及化学之窗ChemWindow16 3.1 常见的化学制图软件16 3.1.1 ChemSketch16 3.1.2 ISIS/Draw17 3.1.3 Chemistry 4D Draw17 3.1.4 GlassyChemistry17 3.1.5 ChemOffice 201018 3.1.6 ChemDraw18 3.1.7 ChemWindow18 3.2 ChemWindow 6.0的主要功能和特点19 3.3 ChemWindow的安装20 3.4 ChemWindow 的使用方法21 3.4.1 ChemWindow 6.0的程序界面21 3.4.2 画图和编辑基础26 3.4.3 结构编辑命令31 3.4.4 画图样式35 3.4.5 化学命令和工具37 3.4.6 标题和类型样式41 3.4.7 制作和使用模板42 3.4.8 图库42 3.4.9 文件与OLE 2.0的兼容性45 3.4.10 注解工具47 3.4.11 创建图表48 3.4.12 分子量工具49 3.5 ChemWindow应用示例50 3.5.1 绘制分子结构50 3.5.2 绘制化学反应式51 3.5.3 绘制电子转移箭头符号52 3.5.4 绘制图形和文字混合图52 3.6 使用Chem3D绘制三维结构图52 3.6.1 Chem3D简介53 3.6.2 建立Chem3D模型54 3.6.3 整理结构与简单优化58 3.6.4 显示3D模型信息59 3.6.5 改变元素序号与替换元素61 3.7 ChemWindow练习61 参考文献67 第4章 科学绘图及数据分析软件Origin68 4.1 Origin基础知识68 4.1.1 工作环境综述69 4.1.2 菜单栏70 4.1.3 工具栏75 4.2 工作表的使用及数据分析78 4.2.1 输入、编辑和保存工作表78 4.2.2 调整工作表的基本操作80 4.2.3 数据分析81 4.3 数据绘图81 4.3.1 简单二维图形绘制81 4.3.2 选择数据范围作图83 4.3.3 屏蔽曲线中的数据点83 4.3.4 定制图形84 4.3.5 绘制多层图形86 4.4 曲线拟合89 4.4.1 使用菜单命令拟合89 4.4.2 使用拟合工具拟合90 4.4.3 非线性 小二乘拟合91 4.5 Origin的应用93 4.5.1 数据的算术运算93 4.5.2 插值94 4.5.3 微分95 4.5.4 积分96 4.5.5 基线工具97 4.5.6 绘制红外光谱图98 4.5.7 多条曲线叠加对比图101 4.5.8 双坐标图104 4.6 Origin练习106 参考文献107 第5章 分子模拟软件108 5.1 概述108 5.1.1 分子模拟108 5.1.2 分子模拟方法108 5.1.3 计算机实验108 5.1.4 分子模拟的发展109 5.2 常见的分子模拟软件109 5.2.1 Alchemy 2000109 5.2.2 MolSuite 2000110 5.2.3 ChemSite111 5.2.4 ChemSite Pro112 5.2.5 Molecular Modeling Pro112 5.2.6 Chem3D Ultra113 5.2.7 Molecular Properties114 5.3 MP软件的功能114 5.3.1 主窗口115 5.3.2 图形窗口115 5.3.3 按钮窗口116 5.3.4 菜单窗口116 5.4 文件与分子结构119 5.4.1 存取分子结构文件119 5.4.2 结构显示功能119 5.4.3 构造一个分子120 5.4.4 构造一个多分子体系122 5.4.5 删除部分分子片段122 5.5 分子模拟应用实验122 5.5.1 用“分子的性质”软件构建全同立构聚丙烯分子、聚乙烯分子并计算它们末端的直线距离122 5.5.2 用“分子的性质”软件计算聚丙烯酸甲酯的构象能量123 参考文献125 第6章 文献管理软件EndNote X2126 6.1 概述126 6.1.1 文献管理软件126 6.1.2 EndNote软件的特点126 6.1.3 EndNote软件的基本功能126 6.1.4 EndNote软件中用到的几个术语127 6.1.5 EndNote X2软件的新功能127 6.1.6 EndNote X2软件的安装和运行环境128 6.2 数据库的建立130 6.2.1 EndNote程序主界面130 6.2.2 手动输入记录建立数据库132 6.2.3 利用在线文献搜索方法建立数据库132 6.2.4 利用数据库网站建立数据库134 6.3 数据库的管理145 6.3.1 程序界面145 6.3.2 程序菜单145 6.4 数据库的应用164 6.4.1 Word中的应用164 6.4.2 利用数据库来撰写论文167 6.4.3 修改输出样式169 6.4.4 利用论文模板撰写论文175 6.4.5 EndNote统计分析功能176 6.4.6 笔记的管理177 参考文献177