团头鲂种质资源与育种

序 前言 **章 总论 **节 种质资源研究现状 一、形态学 二、细胞遗传学 三、生化遗传学 四、分子种群遗传学 五、功能基因 六、组学 第二节 遗传改良研究 一、杂交育种 二、选择育种 三、分子标记辅助育种 四、雌核发育育种 五、多倍体育种 第三节 种质资源保护存在的问题及保护策略 一、种质资源保护存在的问题 二、种质资源保护策略 第二章 团头鲂种质资源 **节 团头鲂形态学特征 一、梁子湖团头鲂雌雄生长特征 二、梁子湖、鄱阳湖和淤泥湖团头鲂的形态学比较 三、团头鲂形态性状对体重的影响效果分析 第二节 群体遗传结构 一、线粒体基因组 二、微卫星标记 三、相关序列扩增多态性 第三章 团头鲂分子标记的开发与应用 **节 微卫星分子标记的开发 一、群体构建及测序分析 二、微卫星分布特征及EST-SSR标记的开发 三、微卫星多重PCR体系的构建 第二节 SNP标记的开发 一、基于转录组测序的SNP标记开发 二、基于简化基因组测序的SNP标记开发 第三节 基于微卫星标记的亲子鉴定 一、家系构建及亲子鉴定方法 二、亲子鉴定结果与分析 第四章 团头鲂经济性状的遗传参数评估 **节 团头鲂经济性状的遗传力评估 一、生长性状 二、抗病性状 第二节 生长性状的育种值评估 一、个体单个性状的育种值估算 二、个体综合育种值 第三节 亲本对子代生长快和生长慢群体的贡献及优良亲本选择 一、生长快和生长慢群体的生长表型 二、亲子鉴定分析 三、亲本对生长快和生长慢群体的贡献分析 四、有效群体数量 五、亲本育种值分析 第四节 不同地理群体间杂交优势和配合力分析 一、6月龄生长性状 二、20月龄生长性状 第五章 团头鲂性状关联分子标记的筛选 **节 生长性状相关的分子标记 一、生长性状关联微卫星标记筛选 二、生长性状的QTL定位 第二节 抗病性状相关的分子标记 一、MHC Ⅱ a基因序列的测定与SNP分析 二、转铁蛋白Tf及其受体TfR1-a基因SNP开发、鉴定及抗病关联分析 三、NLRC3-like基因的SNP开发、鉴定及抗病关联分析 第三节 耐低氧性状相关的分子标记 一、基于转录组的低氧相关SNPs的开发 二、fih-1基因耐低氧性状SNPs的开发 第六章 团头鲂新品种华海1号的选育 **节 华海1号的选育过程 第二节 华海1号的遗传进展及稳定性分析 一、遗传进展分析 二、染色体遗传稳定性 三、群体遗传一致性 第三节 华海1号的养殖性能分析 一、历年对比试验结果 二、历年生产性能对比试验结果 第七章 团头鲂三倍体和雌核发育的诱导及鉴定 **节 三倍体的诱导及鉴定 一、诱导方法 二、倍性的鉴定 第二节 团头鲂雌核发育的诱导及形态特征的分析 一、诱导方法 二、诱导结果及鉴定分析 第三节 雌核发育群体的微卫星分析 一、微卫星对雌核发育子代的鉴定 二、雌核发育后代纯合性的评价 三、团头鲂正常群体和雌核发育群体微卫星位点的遗传多样性分析 第八章 团头鲂全基因组测序及比较研究 **节 团头鲂全基因组测序与进化分析 一、团头鲂全基因组测序 二、团头鲂全基因组进化分析 第二节 高密度遗传连锁图谱的构建 一、群体的建立及遗传连锁图谱构建的方法 二、RAD测序数据分析 三、SNP分子标记发掘与基因分型 四、高密度遗传连锁图谱的构建 第三节 不同食性鱼类内源性消化系统的比较基因组学研究 一、内源性消化酶基因家族分析 二、嗅觉基因家族分析 三、味觉受体基因家族结果分析 第九章 团头鲂功能基因组的研究 **节 生长性状相关的组学分析 一、生长性状相关的转录组分析 二、生长性状相关的小RNA组分析 第二节 抗病性状相关的转录组分析 一、细菌感染后团头鲂肝脏的转录组学研究 二、细菌感染后团头鲂肝脏、脾脏、肾脏混合组织转录组学研究 三、细菌感染后团头鲂肝脏小RNA组学研究 第三节 耐低氧性状相关的转录组分析 第四节 肌间骨性状相关的组学分析 一、不同组织转录组分析 二、不同组织miRNA组分析 第十章 团头鲂性状相关基因的结构和功能分析 **节 生长相关基因 一、生长相关基因的克隆 二、生长相关基因对其生长发育的表达调控 第二节 免疫相关基因 一、Toll样受体基因 二、热激蛋白基因 三、MHC Ⅱ基因 四、干扰素调节因子 五、白细胞介素6的表达及其启动子活性分析 六、补体系统基因 七、铁代谢相关基因 第三节 耐低氧相关基因 一、低氧感受基因——phd和fih 二、低氧响应基因——Hif-α家族 第四节 其他相关基因 一、ghrelin、NPY和CCK基因 二、团头鲂MRF家族基因的序列特征和功能分析 三、Dmrt家族基因 主要参考文献